Monolix Suite 2020R1 リリースノート

2020年10月

今回のリリースでは、以下の機能強化とバグフィックスが行われています。

Global display

機能強化：

• すべてのソフトウェアのグローバル表示が改善されました。
• ダークテーマを選択することができるようになりました。
• 数値の表示サイズを変更できるようになりました。
• フォントサイズを変更できるようになりました。
• プロジェクトがロードされていなくても設定画面を表示できるようになりました。
• 表示される有効桁数を変更できるようになりました。

Data set

2020R1 バージョンのデータセットは大幅に進化しました。

機能強化：

• データセットのフィルタリングが可能となりました。データセット内の列に関する条件に基づいて、行の選択と削除、ID の選択と削除を行います。これらのフィルターの論理和および論理積をとることができ、提案されたものの補完的なフィルターを作成することも可能です。複数のフィルターを持つこともできます。
• プロット表示はできますが、Monolix の統計モデルには使用できない共変量 (continuous または categorical）として、STRATIFICATION CONTINUOUS COVARIATE および STRATIFICATION CATEGORICAL COVARIATE 列タイプが追加されました。
• Dataの表示に、Add. covariates が追加されました。ユーザーは、データセットの情報に基づいて共変量を追加することができます。また、観測数（観測 ID ごと）、投与回数、投与計画、初回投与量などの表示項目の名前を変更することも可能です。

Mlxtran

機能強化：

• 腫瘍増殖阻害モデルライブラリが追加されました。
• モデルライブラリの表示が高速になりました。
• ライブラリのフィルターをクリアするためのボタンが追加されました。
• TTE ライブラリが更新され、比例ハザードも記述されるようになりました。

Datxplore

機能強化：

• データビューアは、時間に関する観測値のみを表すプロット観測データに置き換えられました。複数の出力がある場合、いくつかの観測データプロットが作成されます。
• プロットにおいて、投与した時間を常に表示するか、もしくはホバリングした時に表示するかを選択することができるようになりました。
• すべての共変量が、階層化表示のために事前に分類されるようになりました。
• グループの平均値と標準偏差を表示できるようになりました。ビンは、ソフトウェアの他の部分と同じ方法で構成および計算されます。
• 平均値と標準偏差の値をツールチップまたはラベルとして表示することができるようになりました。
• 結果またはチャートタイプごとにプロットをグループ化することができるようになりました。

Monolix

[Monolix Interface]

Data tab:

• Data set を参照してください。

Structural model tab:

• Mlxtran を参照してください。

Initial estimates tab:

• 計算と表示が高速になりました。
• 「discretization」は「grid size」に名前が変更され、デフォルト値は 250 になりました。
• インクリメントボタンが削除されました。
• 複数の参照を持ち、参照の 1 つを強調表示することが可能になりました。
• 参照曲線の外観（ダッシュもしくはギャップ）を変更することが可能になりました。
• 初期値に戻すことが可能となりました。
• 設定の表示/非表示を切り替えることが可能となりました。

Statistical model and tasks tab:

• 垂直スクロールバーが各セクションに表示されるようになりました。
• Tasks と Observation model タスクを閉じることができるようになりました。
• 数式ボタンが移動され、分かりやすくなりました。

Comment tab:

• Comment tab が別のアイコンで表示されるようになりました。
• マークダウンフォーマットのプレビューが、選択した場合にのみ表示されまするようになりました。

Export Menu:

• Monolix プロジェクトを Simulx に直接エクスポートすることが可能となりました。
• VPC データをエクスポートすることが可能となりました。

[Monolix calculation engine]

Population parameter estimation:

• すべての変動性レベルに該当しない場合でも、アルゴリズムが最適化されるようになりました。

Conditional distribution:

• 反復回数を制限するために、Conditional Distribution タスクに、maxNbIteraions パラメータを追加しました。この数に達すると警告が表示されます。

Fisher Information Matrix calculation:

• 一部のパラメータの変動性が低い場合の確率的近似に関するアルゴリズムが更新されました。

Tests:

• 相関共変量をより適切に考慮できるようにテストが更新されました。モデルの共変量とパラメーターの間の相関は、レプリケート全体の平均の線形回帰と、回帰で推定されたベータの t 検定を使用してテストされ、0 と有意に異なるかどうかがチェックされます。このテストは COSSAC でも使用されます。

[Monolix plots]

Observed data chart:

• Datxplore を参照してください。

Correlation of the random effects chart:

• 非相関のランダム効果が適切にエクスポートされるようになりました。

[Monolix Connectors]

機能強化：

• computeChartsData コネクタが更新され、VPC をエクスポートできるようになりました。
• applyFilter、createFilter、editFilter、exportData、fillFixedEffectsByAutiInit、getTests コネクタが追加されました。

バグフィックス：

• Initial estimates において、水平スクロールバーがありませんでした。
• Initial estimates において、2 つ以上のカテゴリを持つカテゴリ共変量のベータ係数は、赤ではなく固定されている場合でも青で表示されていました。
• ベイズ推定が変動のないパラメータに適用されていませんでした。

Sycomore

機能強化：

• 参照プロジェクトを定義してから、参照プロジェクトと比較してすべての目的関数の値を取得することができるようになりました。
• サブディレクトリを削除することが可能となりました。

バグフィックス：

• 離散/TTE プロジェクトの場合、線形化を伴う標準誤差のアイコンが間違っていました。
• Exploratory autostop を無効にした探索的反復回数の設定が適切に表示されませんでした。
• サブフォルダーから複数のプロジェクトを同時にロードするときのソフトウェアの不安定性が修正されました。

Simulx

Simulx は大幅に更新され、新しいユーザーインターフェイスが追加されました。Mlxplore が Simulx に埋め込まれていることに注意してください。

Simulx は、新しいプロジェクトを最初から定義し、Monolix からプロジェクトをインポートし、シミュレーションの任意の要素（モデル、機会、母集団パラメータ、個々のパラメータ、共変量、処理、出力、およびリグレッサー）を定義することを可能にします。これらの要素は、手動定義、Monolix プロジェクトからのインポート、もしくは外部ファイルからのインポートができることに注意してください。これらの要素のすべての定義は「Definition」タブにあります。この Simulx プロジェクトは、保存して再ロードできます。

ユーザーがリアルタイムでいくつかの異なる処理、パラメーターなどを探索できる「Exploration」タブがあります。リアルタイムとは、計算が直接かつ非常に高速に実行されることを意味します。このタブは、Mlxplore 機能に密接に関わっています。投与（量、開始時間など）を変更できることに注意してください。

個体数、パラメータ、共変量、投与、出力の観点から、目的のシミュレーションを定義できる「Simulation」タブもあります。共有される要素と各グループに固有の要素を定義できます。

結果とエンドポイントも利用できるため、ユーザーはトライアルを実行して、結果としてエンドポイントを取得できます。すべての結果には、すべての数値パラメータが定義されている「Results」タブと、すべてのグラフィック出力が表示されている「Plots」タブがあります。プロットは、他のアプリケーションのすべてのプロットと同様に高度なカスタマイズ可能です。

PKanalix

機能強化：

• Data: Data set　を参照してください。
• ユーザーは、濃度、量、体積、および時間の単位を定義できるようになりました。 単位はプロットと結果ファイルにも表示されます。
• 複数の partial AUC を定義することが可能となりました。
• NCA 分析で計算するパラメータを定義することが可能となりました。
• 分析に関する設定においてデフォルトで定義されているパラメータを定義することができるようになりました。
• ポイント数と R2 の情報が CHECK λ_z プロットに表示されるようになりました。
• CHECK λ_z の設定を非表示にすることが可能となりました。
• NCA プロットでは、選択したパラメータのみが表示され、デフォルトで選択されているパラメータのリストは、設定で変更できるようになりました。
• NCA の結果で、Summary をフィルタリングして、いくつかの受け入れ基準に対応する値のみを取得することができるようになりました。
• NCA の結果で、定義されたカテゴリ共変量によって Summary を分割することができるようになりました。