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Accuracy & References

精度ベンチマーク

ドッキングソフトウエア精度
Molegro Virtual Docker 87.0%
Glide 81.8%
GOLD 78.2%
Surflex75.3%
FlexX[*]57.9%

MolDockドッキングエンジンについては、比較評価テストが続けられており、詳細は、MolDock: A New Technique for High-Accuracy Molecular Docking (Journal of Medicinal Chemistry) に掲載されています。

Table 1: Accuracy of selected docking program.A binding mode is regarded as correctly identified if the RMSD (to the native co-crystallized ligand) is less than 2.0Å. Before docking the ligands were energy minimized and randomized and all water molecules were removed from the complex. The dataset consists of the 77 complexes from the Surflex set as defined in Friesner et al.[2].
[*] Based on 76 out of the 77 complexes in the Surflex77 set.
 

リファレンス

Molegro Virtual Docker のパフォーマンスを実証する MolDock ジャーナルペーパーは、1800回以上引用されています。 年代別にソートされたジャーナル参考文献のリストは、 こちらから 入手することができます(Google Scholar のページに移動します)。

Molegro Virtual Docker

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