分子構造作成とADMET 物性予測機能を備えたフリーソフトウエア
MedChem Designer™は、分子構造のスケッチングとADMET物性予測を行うフリーソフトウェアです。 複数の構造を作成し、同時にADMET物性を予測できます。側鎖の違いによる物性の違いを簡単に比較検討することも可能です。 さらに、ADMET Predictorとの組合せで代謝物構造の予測も行うことができます。
MedChem Designer™は、 最も精度の高いADMET Predictor®の機能を用いて、ADMET物性予測を迅速に精確に計算します。他の描画ソフトに無い機能や直感的なインターフェースにより、医薬品、化粧品、化学薬品、除草剤、殺虫剤や食品添加剤など新規合成化合物を設計する研究者の方々に満足いただけるソフトウェアです。
予測ADMET物性は、
分子量、logP、logD (7.4)、TPSA (Topological Polar Surface area)、HBDH (Number of Hydrogen Bond Donor Protons)、HBA (Number of Hydrogen Bond Acceptors)、Rule of 5およびPEOE sigma charge (Partial Equalization of Orbital Electronegativity by Gasteiger and Marsili)です。
複数の構造を取り扱えることで、望ましい物性を持つと分かった構造をリファレンスとして置いておき、次にその構造を修飾し、修飾された構造の物性を即座に予測し、オリジナルの構造と比較することもできます。
MedChem Designer™は多くの画期的な機能を搭載しています。
- 側鎖の結合や二面角の修正
- 共通骨格構造に基づくアライメント
- 構造最適化機能（描画構造の最適化：構造の一部を固定することも可能）
- 構造の一部をキャプチャーして、新しいテンプレートとして保存
- 単一画面上で複数の構造を描画
MedChem Designer™は、こちら（Simulations Plus社のサイト）からダウンロード可能です。
- ADMETPredictor®で作成した構造をクエリーとして読み込むことができます。
- ADMET Predictor®： MedChem Designer™で、ADMET Predictor®を指定するだけで、ADMET Predictor®のモジュールに応じた物性予測が可能となります。例えば、Physicochemical & Biopharmacueitcsモジュールをお持ちであれば、pKa、溶解度、ヒト膜透過性、BBB透過性などが予測可能となり、また、Toxicityモジュールをお持ちであれば、各種毒性予測が、さらにADMET Predictor® 5.5からリリースされたMetaboliteモジュールをお持ちであれば、代表的なCYPによる代謝部位も予測することができます。