バイオイメージングデータ統合管理システム - BioSpect™

BioSpect™ は、共焦点レーザー顕微鏡や二光子顕微鏡、蛍光顕微鏡等から得られるイメージングデータをデータベース化し、関連データと共に管理できるデータベースシステムです。Web方式のネットワーク利用により、イメージングデータの保管・検索・共有を実現します。

BioSpect™ は、共焦点レーザー顕微鏡や二光子顕微鏡、蛍光顕微鏡等で撮影した、イメージング画像を関連データと共に管理できるデータベースシステムです。今まで、顕微鏡で取得し処理を行ったStack File画像、動画を確認するためには、専用のソフトウェアで1つ1つ開いて確認する必要があり、研究全体の非効率の原因となっていました。BioSpect™ を利用することで、データ登録、検索、共有の面で研究全体の効率化が可能となります。

Fig. 1. BioSpecttrade; データ一覧表示例

BioSpect™ は、弊社製品である機器分析データの統合管理システムChartSpect^® から派生したバイオイメージングのためのデータ管理システムです。イメージングデータについては、様々な種類の顕微鏡が各メーカーから発売されており、また、多数の画像処理ソフトウェアが存在していることから、「データの統合的な管理ができていない」というお客様のニーズを受け開発を行っています。

様々なデータフォーマットに対応

BioSpect™ は、LSMファイル、16bit Multi TIFFファイルなどの様々なStackデータをJPEG、PNGなどの画像、あるいはFLASH動画に軽量化して表示します。

研究テーマに合わせたカスタマイズ

画像データ以外にも研究に必要なデータの管理を行うカスタマイズに対応致します。
例えば、FCS（蛍光相関分光）やFCCS（蛍光相互相関分光）のスペクトルデータ等を変換することも可能です。

Fig. 2.

Fig. 3.

データベース化 - 簡便なデータ登録

• 画像、動画データの登録

画像、動画データのフォーマットを設定してボタンを押すだけでデータベースへの登録が可能です。

• テキスト、数値データの登録

エクセル感覚でデータを入力・編集、あるいは他のファイルからコピー＆ペーストし、データベースへ登録できます。

Fig. 4. Data Uploader ウィンドウ

自由なレイアウト表示

BioSpect™ では、目的毎にレイアウトを自由に作成することが可能です。

例えば、サンプル名、日付、実験者ID、スタックファイルを一列に並べて表示したり、画像データとスペクトルデータを並べて表示することが出来ます。

Fig. 5. レイアウト表示例

様々な条件でのデータ検索

BioSpect™ は、登録されているデータ項目に対して検索条件を指定して検索します。 検索演算子を組み合わせて指定することにより複雑な検索も可能なため、必要なデータを的確に探し出すことができます。

Fig. 6. データ検索ウィンドウ

データの共有化

• Web方式によるネットワーク利用

複数のユーザが同時に利用することができ、ネットワークが繋がってさえいれば地域的に離れた場所からでも利用することができます。他研究室や少し離れた事業所の方、共同研究先とのデータ共有などで研究を効率的に進めることも可能です。

• ユーザ管理機能

システム管理権限、データベース作成権限などの管理者権限の付与、各データベースのアクセス権限をユーザ毎に管理することができます。

• データのダウンロード機能

登録されている生データをダウンロードが可能です。必要なデータを検索し専用ソフトウェアで再解析をすることが可能です。居室PCに専用ソフトウェアが入っている場合、即作業を開始する事も可能になります。

Fig. 7. BioSpect™ データ転送とアクセス

稼働環境要件

サーバ動作環境	クライアント動作環境
OS：Linux（RedHatEL、Fedora）	Windows 10 以上（Microsoft Edge, Google Chrome）

オンサイトでのデモ、トライアルを承っております。お気軽に弊社までご連絡ください。